歐盟議會已于2003年7月2日通過了有關法規，強制對所有轉基因食品進行標識。這一法規的通過將有可能終止歐盟對轉基因農作物的非官方禁令，但也許仍不足以使美國撤消貿易訴訟。這項尚需得到歐盟成員國政府最后批準的法規要求食品行業將轉基因生物與常規農作物進行隔離，并制定嚴格的限制措施，防止轉基因生物混入傳統進口食品。針對歐盟五年來對轉基因新品種的事實上的禁令，美國已與阿根廷及加拿大等其他轉基因出口國一起向WTO提出了訴訟請求，這一問題一直是引起大西洋兩岸貿易摩擦的根源。僅美國一方提出的由于歐盟政策導致的農民出口損失就達每年三億美元，其中主要是玉米。 1998年，瘋牛病丑聞的發生使歐盟消費者對食品安全問題的擔心達到了頂點，此后，歐盟便開始拒絕批準任何新的轉基因作物在15個成員國里種植和食用。 以法國為首的對轉基因持懷疑態度的國家認為，在歐盟對安全性檢驗、標識以及從農場到餐桌的追溯調查制定出一系列新的法規之前，應對轉基因產品實行暫時禁止。 這次通過的新法規規定，在進口到歐盟的非轉基因產品中意外混入的轉基因物質不能超過0.9%，法規還要求歐盟各國制定適當的措施，以保證在成員國中種植轉基因作物不會通過交叉授粉傳播給傳統物種。 這項新法規可能將整合到歐盟最終法規體系中，從而將允許成員國重新開始已經停止的轉基因審批程序，但對轉基因產品持否定態度的人認為還有很多事沒做。 地球之友等環境保護組織擔心，一些抗病蟲害的轉基因作物會與野生親緣植物雜交，從而形成難以控制的超級雜草。該組織希望歐盟能制訂轉基因農業生產技術方面的法規，以確保不會產生植物間的交叉授粉，并形成一個法律制度，一旦農民或生物技術種子生產者對自然界的生物物種造成損害要承擔經濟責任。（ 佚名）